上海申鑫足球俱乐部，在2003年成立于上海市闸北区。闸北区体育局以精文足球学校的学员为班底，组建俱乐部（上海衡源足球俱乐部）参加当年的中乙联赛，以解决学员的出路问题。

　　2004年初，上海衡源足球俱乐部出资买下解放军八一青年队，并将主场移至南昌八一体育场。2005年年底，南昌八一衡源以乙级联赛冠军升入甲级联赛。2008年获中甲联赛季军；2009年获中甲联赛亚军；2009年底，南昌八一衡源以中甲联赛亚军升入中超。

　　2012年2月，俱乐部宣布回迁起点上海，更名为上海申鑫足球队，主场设在金山足球场。该赛季，上海申鑫以6胜12平12负的成绩排名联赛第15，后因大连实德资产转让予大连阿尔滨被取消资格而得以继续留在中超。

　　2013赛季，上海申鑫在艰难中坚定前行，以联赛第七的成绩，力压同城中超兄弟申花和上港，成为2013赛季中超联赛上海足球版图上的第一名。2014赛季，上海申鑫以9胜6平15负的成绩，排名联赛第11。

　　2015赛季，上海申鑫提前3轮降级，结束了6年中超征程，成为2015赛季第一支降级的中超球队。2016赛季，上海申鑫排名中甲第10位。